Aparatul administrativ
- Preşedinte al CNAA
Valeriu CANŢER - academician
- Vicepreşedinte al CNAA, conducător al Comisiei de acreditare a organizaţiilor din sfera ştiinţei şi inovării
Simion TOMA - academician
- Vicepreşedinte al CNAA, conducător al Comisiei de atestare a personalului ştiinţific şi ştiinţifico-didactic
Veaceslav PERJU - doctor habilitat, academician – membru al Academiei Internaţionale de Informatizare a ONU
- Secretar ştiinţific al CNAA
Gheorghe GLADCHI - doctor habilitat
I. Direcţia Generală de Evaluare şi Acreditare
- Secţia ştiinte reale
- Secţia ştiinte umanistice
II. Direcţia Generală de Atestare
- Secţia ştiinţe reale
- Secţia ştiinte umanistice
III. Direcţia Generală de Pregatire a Cadrelor Ştiinţifice de Înaltă Calificare
- Secţia monitorizare a doctoranturii
- Secţia financiar-administrativă